A principal diferença entre a polimerase Taq e Pfu é que a polimerase Taq possui atividade de revisão de exonuclease 5′-3′, enquanto a polimerase Pfu possui atividade de revisão de exonuclease 3′-5′.
A DNA polimerase catalisa a síntese de DNA durante a replicação. A DNA polimerase utiliza uma fita de DNA molde para sintetizar a fita de DNA complementar. Além de sua função como polimerase, ajuda na revisão de DNA e reparo de danos por meio de sua atividade de exonuclease. A polimerase Taq e Pfu são duas enzimas polimerase principais. A polimerase Taq pertence à família A, enquanto a polimerase Pfu pertence à família B. São polimerases replicativas e de reparo e desempenham um papel importante na reação em cadeia da polimerase (PCR).
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença chave
2. O que é Taq Polimerase
3. O que é Pfu Polimerase
4. Semelhanças – Taq e Pfu Polimerase
5. Taq vs Pfu Polimerase em Forma Tabular
6. Resumo – Taq vs Pfu Polimerase
O que é Taq polimerase?
A Taq polimerase é uma DNA polimerase 1 termoestável que recebeu esse nome após sua descoberta no microrganismo eubacteriano termofílico Thermus aquaticus. T. aquaticus é uma bactéria que vive em condições extremamente quentes, como fontes termais e fontes hidrotermais. A Taq polimerase é identificada como uma enzima resistente a altas temperaturas; portanto, é amplamente utilizado durante a PCR. A polimerase Taq tem uma estrutura semelhante à polimerase A de E. coli. Ela consiste em um domínio funcional de exonuclease 5′-3′ na extremidade do terminal de aminoácidos. Os dois domínios restantes agem em coordenação através do movimento de domínio acoplado.
Figura 01: Taq Polimerase
A temperatura ótima da Taq polimerase para sua atividade é de 75 a 80 °C. A enzima tem a capacidade de replicar uma fita de DNA de 1000 pb em menos de dez segundos a 72°C. A 75-80°C, a enzima atinge sua taxa de polimerização ideal, que é de 150 nucleotídeos por segundo por molécula de enzima. O uso de Taq polimerase facilita a alta especificidade dos primers e reduz a produção de produtos não específicos, como dímeros de primer.
O que é Pfu Polimerase?
Pfu polimerase é uma enzima encontrada no arqueo hipertermofílico Pyrococcus furiosus. Ajuda a copiar o DNA do organismo durante a divisão celular. A enzima pertence à família B da DNA polimerase e consiste em um domínio de exonuclease 3′-5′. Semelhante à polimerase Taq, a polimerase Pfu também é usada para amplificar o DNA na PCR.
Figura 02: Pfu Polimerase
A polimerase de Pfu tem propriedades termoestáveis e de revisão altas. A enzima possui atividade de revisão de exonuclease 3′-5′. Portanto, quando o DNA se monta a partir da extremidade 5′-3′, a atividade exonuclease da polimerase Pfu ajudará a remover os nucleotídeos incompatíveis da direção 3′-5′. Como resultado, os fragmentos de PCR gerados pela polimerase Pfu consistem em menos erros. A Pfu polimerase também exibe uma fidelidade de replicação significativamente mais alta. No entanto, a Pfu polimerase é mais lenta e requer cerca de um a dois minutos por ciclo para amplificação a 72°C.
Quais são as semelhanças entre a polimerase Taq e Pfu?
A polimerase Taq e Pfu são enzimas polimerase. Além disso, eles são usados como enzimas em PCR. As polimerases Taq e Pfu são enzimas termoestáveis. Eles são isolados de organismos procarióticos. Ambos consistem em atividade de revisão de exonuclease.
Qual é a diferença entre a polimerase Taq e Pfu?
A polimerase Taq possui atividade de revisão de exonuclease 5′-3′, enquanto a polimerase Pfu possui atividade de revisão de exonuclease 3′-5′. Assim, esta é a principal diferença entre a polimerase Taq e Pfu. A Taq polimerase recebeu o nome da bactéria Thermus aquaticus, enquanto a Pfu polimerase recebeu o nome do archaeon Pyrococcus furiosus. Além disso, a polimerase Taq pertence ao grupo A da DNA polimerase, enquanto a polimerase Pfu pertence ao grupo B da DNA polimerase.
O infográfico abaixo apresenta as diferenças entre a polimerase Taq e Pfu em forma de tabela para comparação lado a lado.
Resumo – Taq vs Pfu Polimerase
A polimerase Taq e Pfu são duas enzimas polimerase principais. A polimerase Taq possui atividade de revisão de exonuclease 5′-3′, enquanto a polimerase Pfu possui atividade de revisão de exonuclease 3′-5′. Esta é a principal diferença entre a polimerase Taq e Pfu. A polimerase Taq pertence à família A, enquanto a polimerase Pfu pertence à família B. Assim, isso resume a diferença entre a polimerase Taq e Pfu.
Referência:
1. Ishino, Sonoko e Yoshizumi Ishino. “DNA polimerases como reagentes úteis para a biotecnologia ‒ a história da pesquisa de desenvolvimento no campo.” Fronteiras em Microbiologia, vol. 5.
2. “Pfu DNA Polimerase.” Uma visão geral | Tópicos ScienceDirect.
Cortesia da imagem:
1. “PDB 1ktq EBI” Por Jawahar Swaminathan e funcionários da MSD no Instituto Europeu de Bioinformática – (Domínio Público) via Commons Wikimedia
2. “Pfu Polymerase PCNA complex ribbon 3a2f bio r 500” Por RCSB (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia